Muxtar nəqliyyat vasitələrinin inkişafında GPS texnologiyasına etibar edən naviqasiya sistemlərinin effektivliyini poza biləcək bir neçə çətinlik yaradır. Bir əhəmiyyətli məsələ, xüsusən də hündür binaların "şəhər kanyonları" yaratdığı şəhər mühitlərində siqnal pozulmasıdır. Bu quruluşlar GPS siqnallarını maneə törədə bilər və əks etdirən yerləşdirmə məlumatlarına səbəb ola bilər. Muxtar nəqliyyat vasitəsi olaraq, protrack GPS sistemi kimi sistemlərdən istifadə edərək, mürəkkəb şəhər mənzərələrini gəzməyə çalışın, standart GPS naviqasiyasının məhdudiyyətləri getdikcə aydın olur. Bu cür uyğunsuzluqlar, dəqiq yer məlumatlarına çox güvənən nəqliyyat vasitələrinin qərar vermə proseslərini poza bilər.
Digər bir kritik problem, boşalmaların zərərli bir mövqeyi hesablamaq üçün bir GPS qəbuledicisini aldatmaq üçün saxta siqnalların ötürüldüyü zərərli müdaxilənin zəifliyidir. Bu tip kiberemə təhlükəsi muxtar nəqliyyat vasitələrinin təhlükəsizliyi üçün əhəmiyyətli bir risk yaradır. Yalnız protrack GPS izləyicisinə güvənmə nəticələri, bir vasitə təhlükəli vəziyyətlərlə nəticələnə bilər, əgər bir nəqliyyat vasitəsi manipulyasiya edilmiş siqnallar səbəbindən yerini səhv izah edirsə. Bu risklərə toxunan təhlükəsizlik tədbirləri və əlavə sistemlərin inteqrasiyasını zəruri edir.
Bundan əlavə, peyk görüntüsündəki asılılığı bir məhdudiyyət ola bilər. Mənfi hava şəraitində güclü yağış və ya qar kimi, GPS texnologiyasının dəqiq və etibarlı bir siqnal qorumaq qabiliyyəti xeyli zəifləyir. Bu məhdudiyyət, protrack GPS sisteminin, hərtərəfli naviqasiya imkanları təklif etmək üçün, GPS Sisteminin alternativ texnologiyalarla birlikdə alternativ texnologiyalarla əməkdaşlıq etməsi lazım olan optimal sensor füzyonunun zəruriliyini vurğulayır. Muxtar vasitə araşdırmalarının mütəxəssisləri naviqasiya üçün çox yönlü bir yanaşmanın bu çətinlikləri əhəmiyyətli dərəcədə azalda biləcəyini, muxtar nəqliyyat vasitələrinin müxtəlif mühitlərdə təhlükəsiz və səmərəli səyahətini təmin etməsini təmin edə biləcəyini vurğulayırlar.
